当实缴资本超过注册资本后，确实可能影响股东的权益比例。根据《公司法》的相关规定，股东权益比例通常基于其出资额确定。若实缴资本超出注册资本，公司可选择增资扩股，重新划分出资份额比例，这将直接影响各股东的权益比例。此外，若选择将超出部分视为公司向股东借款，则不影响原有股权结构，但股东间可能存在债权关系。
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